موزه آيينه و روشنايي يزد : اين موزه در خيابان آيت الله كاشاني، رو به روي پارك هفتم تير قرار دارد. موزه آيينه و روشنايي در سال 1377 هجري شمسي، پس از انجام تعميرات اساسي در خانه «صراف زاده»، در اين مكان افتتاح شد. اين موزه با زير بناي 837 متر مربع در باغي مصفا با وسعت 8174 متر مربع قرار دارد. اين موزه تنها موزه تخصصي در رابطه با موضوع نور در ايران است و شامل انواع پيه‌ سوز، شمع سوز، نفت سوز و اشياي برقي است. اشياي موجود در اين موزه از جنس سفال،‌ شيشه، برنج، مس و برنز است. از اشياي خاص موجود در اين موزه مي‌توان به پيه‌سوزهاي پايه‌دار چند شعله سفالي، آيينه‌هاي سنگي و كارهاي هنري انجام شده بر روي شيشه و آيينه اشاره كرد. 

موزه آب يزد : موزه آب يزد هم‌زمان با برگزاري نخستين همايش بين‌المللي قنات در ارديبهشت ماه سال 1379 هجري شمسي در شهر يزد افتتاح شد. اين موزه محل مناسبي براي شناخت آثار و ابنيه تاريخي مربوط به آب است.
در اين موزه لوازم مختلف حفر قنات، ابزار و ادوات اندازه‌گيري حجم آب، وسايل تأمين روشنايي در قنات، اسناد و مدارك خريد و فروش آب و وقف نامه هاي قديمي، كتابچه ميراب‌ها و اسناد توزيع آب، ظروف نگهداري و حمل آب و بسياري لوازم و اشياء ارزشمند ديگر نگهداري مي شود. موزه آب در يكي از ارزشمندترين آثار معماري سنتي يزد، به نام خانه «كلاه‌دوزها»، قرار دارد.  

موزه علوم طبيعي يزد : اين موزه در مساحتي به وسعت يك هزار متر مربع، در محل مدرسه «ايرانشهر» تأسيس شد و شامل بخش‌هاي زمين شناسي، جانورشناسي و گياه‌شناسي استان است.

موزه پلاس ميبد : اين موزه در كاروانسراي شاه عباسي« چاپارخانه» شهرستان ميبد قرار دارد. تعداد زيادي از زيلوهاي قديمي مساجد و ديگر اماكن تاريخي در اين موزه نگهداري مي‌شود. قديمي‌ترين زيلوي موجود در اين موزه، مربوط به قرن نهم هـ . ق است. در كنار اين موزه، چند كارگاه بافت زيلو داير شده است. در اين كارگاه ها، طرح‌هاي تاريخي زيلو توسط استادكاران مجرب دوباره بافته مي‌شود. در كنار اين موزه رستوران سنتي ميبد قرار دارد.

موزه مردم شناسي مهريز : اين موزه در محل يك حمام قديمي متعلق به اوايل دوره قاجاريه به نام حمام «استهريج»  قرار دارد. طرح بنا مانند ساير حمام‌هاي قديمي به صورت زيرزمين است و با مساحتي حدود ششصد و پنجاه مترمربع، در شش متري عمق زمين واقع شده و پشت بام آن هم‌ سطح خانه‌هاي اطراف است. قبه‌هاي موجود بر روي سقف و شيشه‌هاي رنگي كه بعد از مرمت در آن به كار رفته است، با انعكاس نور طبيعي محيط زيبايي را براي موزه فراهم مي سازد. در مجموع بيش از ششصد اثر فرهنگي و تاريخي شامل ابزار و ادوات جنگي و كشاورزي، پوشاك سنتي، اسناد و قباله‌هاي قديمي، ظروف شيشه‌اي فلزي، سفالي و غيره در اين موزه گردآوري شده است.